Modelo de proteínas ESM
La empresa BioHub ha anunciado el lanzamiento de ESMFold2, un modelo de proteínas que permite predecir y diseñar estructuras biológicas con precisión. Este modelo es parte de la iniciativa de BioHub para desarrollar un modelo de proteínas que pueda aprender y generalizar a partir de grandes cantidades de datos.
Los investigadores de BioHub han entrenado a ESMFold2 con millones de secuencias de proteínas y han logrado que el modelo aprenda no solo la estructura biológica, sino también la función de las proteínas. El modelo ha demostrado un rendimiento superior en la predicción de interacciones proteicas, especialmente en el caso de los anticuerpos, que son fundamentales para el desarrollo de terapias. El equipo de BioHub ha publicado un atlas de 6,8 mil millones de proteínas y 1,1 mil millones de estructuras predichas, que están disponibles en su sitio web.
“El equipo de BioHub ha publicado un atlas de 6,8 mil millones de proteínas y 1,1 mil millones de estructuras predichas, que están disponibles en su sitio web”
El enfoque de ESMFold2 se basa en el aprendizaje no supervisado de la relación entre diferentes proteínas, lo que permite al modelo generalizar y predecir estructuras biológicas sin necesidad de datos de entrenamiento específicos. Esto se logra correlacionando la información aprendida con estructuras conocidas de la base de datos de proteínas (PDB) y otras fuentes. El modelo ha demostrado ser efectivo en la predicción de estructuras biológicas, incluso en casos donde otros modelos, como AlphaFold2, tienen dificultades.
La iniciativa de BioHub para desarrollar un modelo de proteínas que pueda aprender y generalizar a partir de grandes cantidades de datos tiene implicaciones importantes para el campo de la biología y la medicina. El modelo puede ser utilizado para diseñar nuevos fármacos y terapias, y para entender mejor la función de las proteínas en el cuerpo humano. El lanzamiento de ESMFold2 es un paso importante hacia el desarrollo de un modelo de proteínas que pueda ser utilizado para mejorar la salud y el bienestar humano.